Логи надо смотреть. Может права на файлы ключей не подходящие стоят. 

Попробуй еще вот так параметр указать:

AuthorizedKeysFile %h/.ssh/authorized_keys

/var/log/secure ? Или другой?

AuthorizedKeysFile %h/.ssh/authorized_keys  - попробовал, Права: /.ssh - 0700, auhtorized_keys - 0644
Результата нет. А папка пользователя будет искаться в директории home?

Подскажите в каких логах и какую инфу надо поискать?

А система какая? Если Centos 7 то /var/log/secure, /var/log/audit/audit.log

Если пользователя не пускает по ssh, об этом обязательно будет информация в логах.