Если обновляется ядро, то надо перезагрузиться, чтобы система запустилась на новом ядре. В платных версиях Ubuntu или RHEL линукс есть технология, которая позволяет обновлять ядро без перезапуска всей системы. В бесплатных системах такого нет. Так что если в ядре не было обновлений или там нет чего-то критичного, то можно не перезагружать систему. Но время от времени это нужно делать.