@dimon4ic я ни разу не сталкивался, но можно глянуть, что там zabbix_agent делает и какие файлы держит. 

lsof /dev/sda

Указать диск можно любой, либо только какую-то папку или точку монтирования.

Можно ли отключить слежение в правилах обнаружения шаблона за конкретной файловой системой, той же zfs? подобное не нашёл как условие создать

@dimon4ic можно его просто отключить. После того, как оно отработало и определило все файловые системы, автообнаружение можно просто выключить. Вряд ли у вас часто меняется состав файловых систем. Вообще, в шаблоне предусмотрен механизм исключений, но я никогда не разбирался, как он работает. Не было нужды. 

нашёлся ответ
Если вы не хотите отслеживать в Shared memoryсвоей системе, вы можете легко добавить его в выражение фильтра.

Для этого перейдите в "Администрирование"->"Общие"->"Регулярные выражения"
Выберите Storage devices for SNMP discoveryзапись
Добавить Shared memoryзапись в список
В то же время вы также можете удалить различные /run/xxxфайловые системы из обнаружения.

Мое текущее выражение:

^(Physical memory|Virtual memory|Memory buffers|Cached memory|Swap space|Shared memory|/sys/fs/cgroup|/run/lock|/dev/shm|/run/user|/run/user/0|/run)$